Profesión: bióloga

Área (s) de especialización: Ciencias Biológicas

Categoría en la ACCEFYN:

Miembro Correspondiente: Si

Fecha de posesión: marzo 25 de 2015

Datos personales:

Fecha de nacimiento: febrero 6 de 1964

Lugar de nacimiento: Cali

Departamento/Estado/Provincia: Valle

País: Colombia

Dirección particular: calle 57 no. 36ª-47 apto 202 Nicolas de Federman, Bogotá.

Teléfono : 57 310 3219220

Dirección institucional:

Carrera 7 No. 43-82 Depto de Biología. Pontificia Universidad Javeriana. Tel 571 3208320 ext 4170

Dirección electrónica (e-mail): baena@javeriana.edu.co

Hoja de Vida (Currículum Vitae) en línea: http://scienti1.colciencias.gov.co:8081/cvlac/visualizador/generarCurriculoCv.do?cod_rh=0000074721

Página (sitio) Web:

Títulos académicos:

1994-1998. Doctorado en Ciencias. Université de Provence, Aix-Marseille I. Marsella (Francia).

1988-1991. Magistra en Saneamiento y Desarrollo Ambiental.

Pontificia Universidad Javeriana. Bogotá (Colombia).

1982-1986. Bióloga. Pontificia Universidad Javeriana.

Bogotá (Colombia).

Áreas de investigación:

Ecología y diversidad microbiana de manantiales termales y salinos de Colombia. Biotecnología.

Reseña Biográfica

Sandra Baena Garzón nació en Cali el 6 de febrero de 1964. Adelantó estudios profesionales en la Pontificia Universidad Javeriana, donde recibió el título de Bióloga en 1986. Inició su trabajo de investigación en el Departamento de Biología de la Universidad Javeriana donde formó el grupo de investigación en Saneamiento y Biotecnología Ambiental (USBA) en el año 1988 en conjunto con profesores de la Facultad de Ingeniería. Posteriormente inició sus estudios de Maestría en Saneamiento y Desarrollo Ambiental en la misma universidad, obteniendo en 1991 su grado de Magister. En el año 1994 inició sus estudios de doctorado en Francia en la Université de Provence, Aix-Marseille I. Marsella. En el año 1999 regresa al país para reincorporarse a su grupo de investigación en la Universidad Javeriana.

Las áreas de investigación son diversidad y ecología microbiana de sistemas anaerobios de tratamiento de aguas residuales y de manantiales termales y salinos. Ha liderado diversos proyectos de investigación y ha participado en dos centros de excelencia financiados por Colciencias (Centro de Excelencia (CIEBREG) en Investigación y Estudio en Biodiversidad y Recursos Genéticos y Centro de Excelencia (Colciencias) (GEBIX) en Metagenómica y Bioinformática para la caracterización y el aprovechamiento de recursos genéticos de ambientes extremos. Ha sido Profesora Visitante en varias Universidades y centros de investigación en Europa (Francia (2002, 2003, 2011, 2012, 2013), España (2006), Holanda (2004)). Ha participado en más de 60 congresos y reuniones nacionales e internacionales, y es autora de 25 publicaciones científicas, 4 divulgativas y 8 capítulos en libros. A través de su carrera profesional ha participado activamente en la formación de biólogos y microbiólogos. Desde 2001 ha dirigido 18 y codirigido 4 trabajos de grado a nivel de pregrado: tres de éstos ganaron la Mención de Honor de la Facultad de Ciencias  (año 2008, 2010 y 2011). Desde el 2005 ha dirigido 6 tesis de Maestría y codirigido una, siendo esta distinguida como Laureada (2011) y otra reconocida como meritoria (2014). Ha dirigido cuatro tesis doctorales, donde una fue distinguida como laureada (2011) y otra como meritoria (2015). Fue Miembro del Consejo Nacional de Biotecnología en COLCIENCIAS desde 2005 a 2010 y es Miembro correspondiente de la Academia Colombiana de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales desde Marzo de 2015.

Premios y reconocimientos recibidos:

• Becaria BID-Colciencias II etapa para estudios de doctorado en el exterior (1994-1999)

• Becaria del Gobierno Francés Programa P.C.P. (1995-1998)

• Becaria de International Foundation for Science (IFS). Grant research agreement number E/3263-1.

• Becaria del International Foundation for Science (IFS). Grant research agreement number E/3263-2.

• Finalista en el Programa Piloto para proyectos de investigación con potencial empresarial DAVINCI. Secretaria Distrital de Desarrollo Económico. 2009. Acompañamiento en el proceso de formulación del modelo de negocios de una empresa para el proyecto “Producción de Ácido láctico por cepas termofílicas a partir de subproductos del procesamiento de Aloe vera”.

• Ganadora asignación de recursos económicos para apoyo a la investigación dentro del Programa Davinci II (2011). Secretaria Distrital de Desarrollo Económico e Inventta Colombia. Proyecto “Producción de ácido láctico por cepas termofílicas a partir de subproductos del procesamiento de Aloe vera”.

• Mención de Honor. Categoría de Ciencias Biológicas. Premio Bienal al investigador javeriano. XII Congreso La Investigación Pontificia Universidad Javeriana. 2013.

• Premio Bienal Javeriano de Investigación 2017 categoría Vida y obra en Ciencias Naturales, Físicas, Exactas y del Medio Ambiente. Pontificia Universidad Javeriana. 2017.

Publicaciones científicas y divulgativas: (lista completa):

Cantillo, A., Shapiro, N., Woyke, T., Kyrpides, N.C., Baena, S. & Zambrano MM. 2018. Genome Sequences of Actinobacteria from Extreme Environments in Colombia. Microbiology Resource Announcements. Volume 7 Issue 999 e01384-18DOI:10.1128/MRA.01384-18.

2018. López, C. Díaz-Cárdenas, J. David Alzate, L. N. Gonzalez, N. Shapiro, T. Woyke, N. C. Kyrpides, S. Restrepo and S. Baena. 2018. Description of Alicyclobacillus montanus sp. nov., a mixotrophic bacterium isolated from acidic hot springs. Int J Syst Evol Microbiol DOI 10.1099/ijsem.0.002718.

Carolina Díaz-Cárdenas; Angela Cantillo; Laura Yinneth Rojas; Tito Sandoval; Susana Fiorentino; Jorge Robles; Freddy A Ramos; María Mercedes Zambrano; Sandra Baena. 2017. Microbial Diversity of Saline Environments: Searching for Cytotoxic Activities. Amb Express. doi.org/10.1186/s13568-017-0527-6.

Carolina Díaz-Cárdenas, Gina López, J. David Alzate, Laura N. González, Nicole Shapiro, Tanja Woyke, Nikos C. Kyrpides, Silvia Restrepo, Sandra Baena. Draft genome sequence of Dethiosulfovibrio salsuginis DSM 21565^T an anaerobic, slightly halophilic bacterium isolated from a Colombian saline spring. Standards in Genomic Sciences (2017) 12:86 DOI 10.1186/s40793-017-0303-x

Gina López, Carolina Diaz-Cárdenas, Nicole Shapiro, Tanja Woyke, Nikos C. Kyrpides, J. David. Alzate, Laura N. González, Silvia Restrepo, Sandra Baena. 2017. Draft genome sequence of Pseudomonas extremaustralis strain USBA-GBX 515 isolated from Superparamo soil samples in Colombian Andes. Journal: Standards in Genomic Sciences. DOI: 10.1186/s40793-017-0292-9.

Díaz-Cárdenas C., A. Caro-Quintero, G. López, L.F. Bernal, J. David Alzate, L. N. Gonzalez, N. Shapiro, T. Woyke, N. C Kyrpides, S. Restrepo, S. Baena. 2017. Draft genome and description of Consotaella salsifontis gen. nov. sp. nov., a halophilic free-living nitrogen-fixing alphaproteobacterium isolated from an ancient terrestrial saline spring. Int J Syst Evol Microbiol. DOI 10.1099/ijsem.0.002185

Palacios P.A., D. Borda-Molina, J. S. Montaña, S. Baena. 2017. Isolation of lipolytic bacteria from Colombian Andean soils: a target for bioprospecting. Journal of Microbiology, Biotechnology and Food Sciences. doi: 10.15414/jmbfs.2017.6.6.1250-1256

2017. Borda-Molina, J. S. Montaña, M. M. Zambrano & S. Baena. 2017. Mining lipolytic enzymes in community DNA from high Andean soils using a targeted approach. Antonie van Leeuwenhoek. DOI 10.1007/s10482-017-0877-8

Bernal LF, G. Lopez, M. Ruiz, R. Vera-Bravo, A. Reyes, S. Baena. 2017. Response Surface Methodology (RSM) for analysing culture conditions of Acidocella facilis strain USBA-GBX-505 and Partial Purification and Biochemical Characterization of Lipase 505 LIP. Univ. Sci. 2017, Vol. 22 (1) DOI: http://dx.doi.org/10.11144/Javeriana.SC22-1.rsmr

Rubiano-Labrador C. & S. Baena. 2016. Análisis del perfil de expresión de proteínas del organismo halotolerante Tistlia consotensis bajo diferentes condiciones de salinidad. Revista de Investigación agraria y ambiental. DOI: 10.22490/21456453.1626

1. López, S.J. Cañas-Duarte, A.M. Pinzón-Velasco, N.E. Vega-Vela, M. Rodríguez, S. Restrepo, S. Baena. (2016). Description of a new anaerobic thermophilic bacterium, Thermoanaerobacterium butyriciformans sp. nov. Systematic and Applied Microbiology. Volume 40, Issue 2, March 2017, Pages 86-91

Gómez-Gómez Javier Antonio, Giraldo-Estrada Catalina, Habeych David, Baena Sandra. 2015. Evaluation of biological production of lactic acid in a synthetic medium and in processing byproducts of Aloe barbadensis Miller (Aloe vera). Univ. Sci. 2015, Vol. 20 (3): 369-385 doi: 10.11144/Javeriana.SC20-3.eobp.

Diaz-Cárdenas C. & S. Baena. 2015. Manantiales salinos: diversidad metabólica y filogenética de microorganismos de ambientes salinos. Rev. Acad. Colomb. Cienc. Ex. Fis. Nat. 39(152):358-373, julio-septiembre de 2015. doi: http://dx.doi.org/10.18257/raccefyn.199.

Rubiano-Labrador, Carolina, Bland Céline, Miotello Guylaine, Armengaud Jean, Baena Sandra. 2015. Salt stress induced changes in the exoproteome of the halotolerant bacterium Tistlia consotensis deciphered by proteogenomics. PLoS ONE 10(8): e0135065. doi:10.1371/journal.pone.0135065

López Gina, Jennifer Chow, Patrick Bongen, Benjamin Lauinger, Jörg Pietruszka, Wolfgang R. Streit and Sandra Baena. 2014. A novel thermoalkalostable esterase from Acidicaldus sp. strain USBA-GBX-499 with enantioselectivity isolated from an acidic hot springs of Colombian Andes. Appl Microbiol Biotechnol. 98: 8603-8616

Carolina Rubiano-Labrador, Céline Bland, Guylaine Miotello, Philippe Guérin, Olivier Pible, Sandra Baena, Jean Armengaud. 2014. Proteogenomic insights into salt toleranceby a halotolerant alpha-proteobacterium isolated from an Andean saline spring. Journal of Proteomics. 97: 36-47.

Delgado-Serrano L, López G, Bohorquez LC, Bustos JR, Rubiano C, Osorio-Forero C, Junca H, Baena S, Zambrano MM. 2014. Neotropical Andes hot springs harbor diverse and distinct planktonic microbial communities. FEMS Microbiol Ecol. 89: 56–66.

Carolina Rubiano-Labrador, Sandra Baena, Carolina Díaz-Cárdenas, Bharat K.C. Patel. 2013. Caloramator quimbayensis sp. nov., an anaerobic, moderately thermophilic bacterium isolated from an Andean terrestrial hot spring. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 63: 1396–1402

Zambrano M.M; Alfaro C.; Baena, S. 2013. Manantiales termales, algo más que recurso recreativo: fuentes de agua y biodiversidad. Revista Innovación y Ciencia. Volumen XX (3): 102-111.

Diego Javier Jiménez, Fernando Dini Andreote, Diego Chaves, José Salvador Montaña,Cesar Osorio-Forero, Howard Junca, María Mercedes Zambrano, Sandra Baena. 2012. STRUCTURAL AND FUNCTIONAL INSIGHTS FROM THE METAGENOME OF AN ACIDIC HOT SPRING MICROBIAL PLANKTONIC COMMUNITY IN THE COLOMBIAN ANDES. PLoS ONE 7(12): e52069. doi:10.1371/journal.pone.0052069.

2012. Dini-Andreote, D. Jiménez, D. Chaves, A. Cavalcante Franco Dias, D. Mazzer Luvizotto, F. Dini-Andreote, C. Cipola Fasanella, S. Baena, R. Gouvêa Taketani, I. Soares de Melo. 2012. The Microbiome of Brazilian Mangrove Sediments as Revealed by Metagenomics. PLoS ONE 7(6): e38600. doi:10.1371/journal.pone.0038600.

Bohórquez L., Delgado-Serrano, L., Lopez, G., Osorio-Forero, C., Klepac-Ceraj, V., Kolter, R., Junca, H., Baena, S., Zambrano, M.M. 2011. In-depth characterization via complementing culture-independent approaches of the microbial community in ana cid hot spring of the Colombian Andes. Environmental Microbiology. DOI 10.1007/s00248-011-9943-3.

Montaña, J.S., Jimenez, D., Hernandez, M., Angel, T., Baena, S. 2011. Taxonomic and functional assignment of cloned sequences from high Andean forest soil metagenomics. Antonie van Leeuwenhoek. DOI 10.1007/s10482-011-9624-8.

Jimenez, D., Montaña, J.S., Alvarez, D., Baena, S. 2011. A novel cold active esterase derived from Colombian high Andean forest soil metagenome. World J. Microbiol Biotechnol. DOI 10.1007/s11274-011-0828-x.

2010. Díaz; S. Baena, B.K.C. Patel, M.L. Fardeau. 2010. Peptidolytic Microbial Community of Methanogenic Reactors from two modified UASBs of Brewery Industries. Brazilian Journal of Microbiology. Vol.41 No.3 Sao Paulo Oct. 2010

doi: 10.1590/S1517-83822010000300022 

Baena S. & Diaz C. 2010. Biodiversidad microbiana y manantiales salinos, ¡ Un mundo para explorar! Revista Innovación y Ciencia volumen XVII No. 1. Pp 17- 25

2011. Baena. N. Perdomo, C. Carvajal; B.K.C. Patel. 2011. Desulfosoma caldarium gen. nov. sp. nov., a thermophilic sulfate-reducing bacterium from an Andean terrestrial hot spring. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 61: 732–736

2009. Díaz, B.K.C. Patel, S. Baena 2009. Tistlia consotensis. gen. nov., sp. nov., a novel aerobic chemoheterotrophic free-living nitrogen-fixing a–Proteobacteria, isolated from a Colombian saline spring. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. (60): 1437-1443 doi:10.1099/ijs.0.010926-0

2010. Díaz, B.K.C. Patel,^. G. Lopez, S. Baena.^. 2010. Dethiosulfovibrio salsuginis sp. nov., an anaerobic slightly halophilic bacterium isolated from a saline spring of Colombia. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 60 (4): 850-853

2007. Díaz, S. Baena; M.L. Fardeau & B.K.C. Patel^. 2007^. Aminiphilus circumscriptus gen. nov. sp nov, an anaerobic amino acid degrading bacterium from an upflow anaerobic sludge reactor. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. (57): 1914-1918.

Thevenieau, F.; M-L Fardeau; B. Ollivier ; C. Joulian; S. Baena. 2007. Desulfomicrobium thermophilum sp. nov., a novel thermophilic sulphate-reducing bacterium isolated from a terrestrial hot spring in Colombia. Extremophiles. (2): 295-303.

Posada Y.; L. Pachón; A. Agudelo; E. Álvarez; C. Díaz; M.L. Fardeau; C. Joulian; B. Ollivier; S. Baena. 2004. Cuantificación, aislamiento e identificación de comunidades anaerobias amilolíticas de un manantial termomineral de Paipa, Boyacá. Revista Colombiana de Biotecnología. VI (2) pp 90-100.

Baena S., M.-L. Fardeau, M. Labat, B. Ollivier, & B.K.C. Patel. 2000. Aminobacterium mobile sp. nov., a new anaerobic amino acid degrading bacterium. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 50: 259-264.

Baena S., M.-L. Fardeau, T.H.S. Woo, B. Ollivier, M. Labat & B.K.C. Patel. 1999. Phylogenic relationship of three amino acid utilising anaerobes Selenomonas acidaminovorans, Selenomonas acidaminophila and Eubacterium acidaminophilum as inferred from partial 16S ribosomal DNA nucleotide sequences. International Journal of Systematic Bacteriology. 49: 969-974.

Baena S., M.-L. Fardeau, M. Labat, B. Ollivier, P. Thomas & B.K.C. Patel. 1999.  Aminomonas paucivorans gen. nov., sp. nov., a mesophilic, anaerobic, amino-acid utilising bacterium. International Journal of Systematic Bacteriology. 49: 975-982.

Baena S., M.-L. Fardeau, M. Labat, B. Ollivier, P. Thomas & B.K.C. Patel. 1998. Aminobacterium colombiense gen. nov., sp. nov., an amino acid-degrading anaerobe isolated from anaerobic sludge. Anaerobe. 4:241-250.

Baena S., M.-L. Fardeau, M. Labat, B. Ollivier, J.-L. Garcia & B.K.C. Patel. 1998. Desulfovibrio aminophilus sp. nov., a novel amino acid degrading and sulfate-reducing bacterium from an anaerobic dairy wastewater lagoon. Systematic Applied Microbiology. 21: 498-504.

González, L.E., R.O. Cañizares, S. Baena. 1997. Efficiency of ammonia and phosphorus removal from a Colombian agroindustrial wastewater by the microalgae Chlorella vulgaris and Scenedesmus dimorphus. Bioresource Technology 60 : 259-262.

Baena, S. Las microalgas: Un potencial biotecnológico para Colombia. (1994). Innovación y Ciencia. 3(1): 26-28

Baena S., C. Campos; L.A. Leal; G. Rojas. Aguas residuales de la industria láctea: II Contribución al manejo de los residuos líquidos de la industria láctea. La importancia de la minimización y el reciclaje. (1994). Ambiente y Desarrollo. (2,3): 93-101.

Baena S., C. Campos; L.A. Leal; G. Rojas. Aguas residuales de la industria láctea: I.  Naturaleza y composición de las aguas residuales (1994). Ambiente y Desarrollo. (2,3): 83-91.

Hodson, E.; S. Baena. Biotecnología y Saneamiento Ambiental. (1992). Ambiente Capital. (1): 32-33.

Hodson, E.; S. Baena; M. Mesa. Biodegradación de orthocide por Pseudomonas sp y Bacillus sp aislados de suelos de cultivo de Limonium sinuatum de la Sabana de Bogotá. (1991) Asocolflores. 10-14.

Capítulos en libros

LUISA FERNANDA BERNAL ARAGON, SANDRA BAENA GARZON. 2013. «Biotecnología, Biorremediación y Manejo Sostenible» En: Biotecnologías E Innovación: el compromiso social de la ciencia. El Compromiso Social De La Ciencia. Editoras Elizabeth Hodson de Jaramillo & Teodora Zamudio. 1ª ed. Bogotá: Editorial Pontificia Universidad Javeriana, 2013. p.149-161. 2013. ISBN: 978-958-716-587-6- 

Baena S., B. Ollivier & B.K.C. Patel. 2009. Genus Aminomonas. The Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology, volume 3. The Firmicutes. Páginas 1167-1169. (Eds) de Vos, P., Garrity, G., Jones, D., Krieg, N.R., Ludwig, W., Rainey, F.A., Schleifer, K.-H. and Whitman, W.B. Springer-Verlag, New York, ISBN: 978-0-387-95041-9.

Baena S., B. Ollivier & B.K.C. Patel. 2009. Genus Aminobacterium. The Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology, volume 3. The Firmicutes. Páginas 1165-1167. (Eds) de Vos, P., Garrity, G., Jones, D., Krieg, N.R., Ludwig, W., Rainey, F.A., Schleifer, K.-H. and Whitman, W.B. Springer-Verlag, New York, ISBN: 978-0-387-95041-9.

Baena S., B. Ollivier & B.K.C. Patel. 2009. Genus Thermanaerovibrio. The Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology, volume 3. The Firmicutes. páginas 1176-1179. (Eds) de Vos, P., Garrity, G., Jones, D., Krieg, N.R., Ludwig, W., Rainey, F.A., Schleifer, K.-H. and Whitman, W.B. Springer-Verlag, New York, ISBN: 978-0-387-95041-9.

Baena S., B. Ollivier & B.K.C. Patel. 2009. Genus Anaeromusa. Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology, volume 3: The Firmicutes. página 1073. (Eds) de Vos, P., Garrity, G., Jones, D., Krieg, N.R., Ludwig, W., Rainey, F.A., Schleifer, K.-H. and Whitman, W.B. Springer-Verlag, New York, ISBN: 978-0-387-95041-9.

Baena, S. and Patel, B.K.C. 2009. Genus Caloramator. En: Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology, volume 3: The Firmicutes. páginas 834-838, de Vos, P., Garrity, G., Jones, D., Krieg, N.R.,Ludwig, W., Rainey, F.A., Schleifer, K.-H. and Whitman, W.B. (Eds.), Springer-Verlag, New York, ISBN: 978-0-387-95041-9.

Andrés Cubillos-Ruiz, Howard Junca, Sandra Baena, Ivonne Venegas and María Mercedes Zambrano. 2009. Beyond Metagenomics: Integration of Complementary Approaches for the Study of Microbial Communities. Metagenomics: Theory, Methods and Applications Editora Diana Marco, Universidad Nacional de Córdoba, Argentina ISBN: 978-1-904455-54-7.

Rivera-Rondón, C.; Valderrama L.T., Baena, S. Prada-Pedreros, S., Chará, J. Valdés, C., Diaz, Y., Gomez, M., Muñoz, S., Pedraza, E., Perez-Mayorga, A., Giraldo., L. 2009. Efecto de los sistemas productivos sobre la calidad del agua y la diversidad en ríos de la ecorregión cafetera. En: Valoración de la biodiversidad en la ecorregion del eje cafetero. Ed. Rodriguez JM. Camargo JC., Niño J. Pineda, A., Arias L. Echeverry, M. CIEBREG. Pereira, Colombia. ISBN 978-958-44-4513-1.